шаговая полимеразная цепная реакция целевого гена

targeted gene walking polymerase chain reaction

[греч. polymeres — состоящий из многих частей, многообразный; лат. re- — приставка, обозначающая повторность действия, и actio — действие; греч. genos — род, происхождение]

вариант обычной полимеразной цепной реакции (см. полимеразная цепная реакция), используемый для амплификации неизвестной нуклеотидной последовательности ДНК, локализованной вверх или вниз (слева или справа) от известной последовательности нуклеотидов. Для этого первый специфический ПЦР-праймер (целевой праймер, т.е. праймер, комплементарный экзону) и второй специфический праймер (внутренний праймер, гибридизующийся с той же нитью ДНК и расположенный близко к сайту целевого праймера) отжигают (гибридизуют) с их целевыми сайтам (мишеням) в геноме. Затем неспецифические, т. н. "шагающие" праймеры, комплементарные нуклеотидным последовательностям, расположенным выше или ниже мишени и сайта связывания внутреннего праймера, используют для амплификации расположенных между ними районов с помощью TaqI ДНК-полимеразы. Эту технику можно применять для выделения нуклеотидных последовательностей, прилежащих к уже известным районам без процедуры их клонирования, а также для ДНК-фингерпринтинга, обнаружения регуляторных районов и др.